2019年6月19日，自然出版集团最新公布了全球2019年自然指数排行榜，统计时间节点为2018年1月1日至2018年12月31日。中国科学院昆明植物研究所在82种全球顶尖自然科学类期刊上共发表研究论文29篇，比2018年榜单增长8篇，自然指数(FC值) 13.48（36.6%）⁺。 

　　昆明植物所2018年的科研成果主要集中在化学（21篇）、生命科学（8篇）和地球环境科学（3篇）三个领域。其中ORGANIC LETTERS收录论文17篇，NATURE COMMUNICATIONS收录论文2篇，CHEMICAL COMMUNICATIONS收录论文2篇，JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY收录论文2篇，Science收录论文1篇, Angewandte Chemie International Edition收录论文1篇, Ecology Letters收录论文2篇,PNAS收录论文2篇。入选论文来自于孙汉董、郝小江、李德铢、高连明、夏成峰、赵金华、刘海洋、吴建强、罗晓东、邱明华、黄锦岭、杨玉荣、邓军等研究员带领的科研团队。 

　　据悉，自然出版集团自2014年首次发布自然指数，自2018年6月起，纳入自然指数统计的期刊数量将由原先的68本增至82本，其中新增18本期刊，剔除4本期刊。在生命科学领域新增Cancer Research、Molecular Psychiatry、PLOS Genetics、Science Advances 、Science Translational Medicine、The ISME Journal: Multidisciplinary Journal of Microbial Ecology、The Plant Cell、eLife等期刊。作为衡量科研机构在基础研究领域和国际高水平学术成果产出方面的一项重要参考指标，自然指数目前已经被全球众多高校和科研机构所采用。