2019年6月20日，科睿唯安（Clarivate Analytics）公布了2018版期刊引证报告（Journal Citation Reports），中国科学院昆明植物研究所主办的《真菌多样性》（英文，Fungal Diversity）最新影响因子（Impact Factor）为15.596，相比去年14.078上涨10.7%，在Mycology学科领域期刊连续两年位列第一。  

　　中国科学院昆明植物研究所在真菌特别是高等真菌的基础研究和应用基础研究领域有较好的积累，建立了我国第二大真菌标本馆，在真菌系统学、真菌化学、真菌资源开发利用等领域，取得了一系列重要创新成果。2011 年 3 月，昆明植物所与泰国菌类研究基金会主任、《真菌多样性》期刊创刊人 K. D. Hyde 教授签署合作协议，《真菌多样性》正式成为研究所官方主办期刊。其办刊宗旨为发表真菌学科高水平创新性研究成果，特别是在真菌多样性、系统学、分子系统发育及进化等方面的重要原创性研究论文，促进真菌学的发展和国际学术交流。9年来，该期刊影响因子逐年上升，自2018年至今，连续两年在全球真菌学领域期刊中位列榜首。 

　　此外，昆明植物所还主办全英文期刊《植物多样性》（Plant Diversity）和《应用天然产物》（Natural Products and Bioprospecting）。Plant Diversity 2019年正式被SCI数据库收录，影响因子暂未得到发布。Natural Products and Bioprospecting被ESCI收录，为植物化学领域开放获取期刊。 

　　研究所主办各期刊阅读、投稿链接如下： 

　　Fungal Diversity

　　Plant Diversity

　　Natural Products and Bioprospecting