据国家自然科学基金委员会资助通知，2013年度中国科学院昆明植物研究所喜获3项NSFC-云南联合基金项目资助，合同总经费620万元：孙卫邦主持的“极小种群野生植物高风险灭绝机制及保护有效性研究”(No.U1302262) ，杨祝良主持的“中国西南鹅膏属真菌的多样性、物种形成与分子进化研究”(No.U1302263)，普建新主持的“云南三江并流区域香茶菜属植物二萜及其抗癌活性研究” (No.U1302223)。 

　　NSFC－云南联合基金由国家自然科学基金委员会与云南省人民政府共同设立，该基金面向全国，是国家自然科学基金的组成部分，由国家自然科学基金委员会负责受理申请。2008至2013年第一期协议书双方累计共同投入经费1.9亿元。根据第二期合作协议，2013至2017年，双方每年分别出资2500万元，累计安排经费2.5亿元，重点支持在生物多样性保护、矿产资源综合利用与新材料、资源与环境、人口与健康4个领域开展基础性、前瞻性、战略性研究。旨在实施“建设创新型云南科技行动计划”，吸引和集聚全国的优秀科技人才，围绕云南省及周边地区经济、社会、科技发展的重大科学问题和关键技术问题开展基础研究，带动云南省的科技发展和人才队伍的建设。2013年，NSFC-云南联合基金共资助项目22项，资助经费4675万元； 

　　目前为止，昆明植物所共获得18项NSFC-云南联合基金项目的支持，合同总经费达3432万元。