天然药物活性筛选中心应用了多种筛选新技术和新方法，目前，中心拥有包括EnVision多标记微孔板检测仪、BD FACSCalibur流式细胞仪、Fortebio Octet生物分子相互作用检测平台、Cellomics ArrayScan VTI HCS高内涵分析仪、LUMINOSKAN ASCENT化学发光酶标仪、Vi-CELL细胞存活率分析仪、DNA扩增仪、7500 Real-Time PCR System实时荧光定量PCR仪、凝胶成像分析仪、高速冷冻离心机、液相色谱仪、超低温冰箱等一批在国内领先的实验设施和数据处理系统，用于药物活性筛选。为了满足药物研发企业的创新需求，中心开放共享了一批先进的实验设备和仪器，可为高校、科研院所和医药企业提供服务。