中国科学院昆明植物研究所植化室第一团支部自成立以来，紧密围绕云南省省直机关团工委和中国科学院昆明植物研究所团委工作指导意见，积极开展各项主题团日活动，不断提高团员的思想政治素质和综合素质，为青年的成长做出了积极贡献。

2024年4月共青团中国科学院委员会发文《共青团中国科学院委员会关于表彰2023年度中国科学院五四红旗团委（团支部）、优秀共青团员、优秀共青团干部的决定》（团字〔2024〕9号）。昆明植物所植化室第一团支部经过前期申报，在所团委的积极组织支持下，获得“五四红旗团支部”称号。